gconf-editor で /desktop/gnome/interface/gtk_key_theme を Emacs にしてもだめ。
gimpとかはオッケーなのに！ (これ重要
答え
xmodmap で Caps Lock を Ctrl にしていたのだがそれがよくなかったらしい。Keyboard Preference -> Layout -> Layout Options -> Ctrl キーの位置で「Ctrl キーは A の左」として解決
正直信じられない。どういうタイミングで firefox がキー入力を引いてきてるのかがすげー気になる(ーー；
